Các thư viện được viết bằng Nextflow

Quy trình phân tích trình tự RNA sử dụng STAR, RSEM, HISAT2 hoặc Salmon với số lượng gen/isoform và kiểm soát chất lượng rộng rãi..

Một bộ sưu tập các mẫu triển khai Nextflow được quản lý (bởi nextflow-io).

Đường ống phân tích để phát hiện các biến thể dòng mầm hoặc soma (xử lý trước, gọi và chú thích biến thể) từ trình tự WGS/mục tiêu.

ChIP-seq gọi cao điểm, QC và đường ống phân tích khác biệt..

Đường ống phân tích QC và cuộc gọi cao điểm ATAC-seq.

Lắp ráp và tạo thùng của metagenomes.

Một quy trình phân tích DNA cổ đại hiện đại và có thể tái tạo hoàn toàn.

Các tệp cấu hình được sử dụng để xác định các tham số dành riêng cho môi trường điện toán tại các Tổ chức khác nhau (bởi nf-core).

Một bằng chứng về khái niệm đường ống RNAseq.

(WIP) quy trình thực hành tốt nhất cho bệnh hiếm gặp.

Nhập HLA chính xác từ dữ liệu giải trình tự thế hệ tiếp theo.

Bằng chứng về khái niệm đường dẫn RNA-Seq với Nextflow.

Biến thể mầm non gọi đường ống Nextflow dựa trên các phương pháp hay nhất của GATK4.